高温故障应急处理中，错误的降温和停机方式会加剧磁悬浮风机损伤，甚至引发安全事故。必须掌握正确的应急操作方法，最大限度降低风险。
磁浮风机停机时必须执行正常停机程序，让转子平稳减速落轴，严禁直接切断总电源紧急停机。紧急断电会导致磁轴承电磁力瞬间消失，转子高速坠落砸坏保护轴承，严重时会造成转子飞出。磁悬浮鼓风机降温时严禁用冷水直接冲洗高温的电机外壳和换热器，冷热骤变会导致部件开裂、密封失效。
只能用工业风扇远距离吹风散热，或用干燥压缩空气吹扫散热片。磁悬浮离心风机机房内严禁存放易燃易爆物品，通风时保持空气流通，防止有害气体积聚。应急处理时必须有两人以上在场，一人操作一人监护，发生意外立即停止作业，撤离现场。
